En stormig novemberkväll lämnar två skuggfigurer en kyrkogård i västra Jämtland. Följande dag upptäcks vandaliseringen. Det blir början på en rad oroväckande händelser som skakar om den jämtländska landsbygden. Och vem är mannen i röd mössa, som bränner biblar på torget i Östersund?
När en kyrklig företrädare faller offer för det första skottet, blir ärendet tydligt. Någon hatar kyrkan och skyr inga medel för att skada och bringa oreda i organisationen.
Prästen Julia Holm är på väg tillbaka i tjänst efter en utmattningsdepression. Julia försöker återvända till vardagen, men hennes tillvaro har skakats om i sina grundvalar. Och efter separationen från sambon Axel, drömmer deras sjuåriga dotter fortfarande mardrömmar – minnen från ett tidigare trauma.
Polisen Axel Eldh slits mellan sitt arbete och sina komplicerade känslor för Julia. Han dras, tillsammans med kollegorna Stina och Joakim, allt djupare in i mordutredningen. Händelseutvecklingen har på kort tid gått från bisarr till alltmer skrämmande.
En kväll sitter en ung flicka utanför Julias dörr. Aslan, Julias inneboende och vän, talar om ett mirakel. Finns det kanske ljus i mörkret?
Men mördaren ligger steget före. Klockan tickar.
När stenar ropar är en spänningsroman om yttre och inre hot, om att hitta tillbaka till sig själv och våga tro på det oförutsägbara.